南怀瑾大师荼毗仪式结束后，弟子们经过讨论商议，在否决了就地不开炉建塔的方案后，于2012年10月5日凌晨四点打开荼毗炉，发现南怀瑾大师的头骨完好无损，上面缀满各色舍利子；头骨一半呈现黄色，一半呈现蓝色；其余身体化成舍利子无数。尤其舌根呈莲花状，舌头为半透明粉红色，过去曾有此异象的据说只有鸠摩罗什法师。
早上2002年，安奉于陕西省扶风县法门寺的佛指舍利子赴台湾巡礼，引起极大轰动。为确保佛指舍利子在运送、巡礼期间的安全，两岸有关方面制定、采取了极其周密的安保措施–在为坛城（放置佛指舍利的鎏金铜塔，重63公斤、高134厘米）安装了重达270公斤的防弹、防火、防震玻璃罩的同时，两岸佛教界400多人，乘两架专机随机护送；到台后，从机场到供奉佛指的台大体育馆，沿途10万信众恭迎，可谓万人空巷；安置佛指的舍利亭内装有红外线感应器和摄像头，可随时监控现场情况；与此同时，由大陆24名武僧、台湾120名金刚组成的护法团，与其他有关人员配合，组成4道屏障，24小时护卫。这一切，足见佛指舍利的珍贵和重要！
遗体火化，不仅是个燃烧的过程，其实也是个熔炼的过程。上述珠状舍利子是身体中的哪些成分熔铸而成的？我们普通人，死后火化时有些人是否也能生成些舍利子？有人分析，佛教界的一些修行之士之所以能够生成舍利子，与其长期素食和饮山泉水有关。菜蔬和山泉中富含各种矿物质，经几十年积累，人体各部含量很多，圆寂火化后便“炼制”出了舍利子。此说是否正确，有待进一步研究。
1994年7月7日的《今晚报》还曾有这样的报道并附有照片：天津市大港医院在对一胆结石患者进行胆囊摘除术后，从其胆囊内发现大如蚕豆、小若米粒的结石近千粒。说来，患结石症的人很多，结石也并不少见，多为水垢样，颜色难看。惟独这位患者的千粒结石，颜色各异，宛如雨花石和宝石，美丽奇特，堪称一绝。这种宝石样的结石与舍利子的生成有关系吗？这个谜只能随着科技进步，看能否有人解开了。
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